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一篇被引用千次的論文,了解AAV血清型1-9

時(shí)間:2023-09-21 熱度:821
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  對(duì)于不少“科研”小白而言,捋清不同血清型的趨向性和表達(dá)量可以說(shuō)是非常之有必要,今天小編就通過(guò)一篇發(fā)表于Molecular Therapy,影響因子8.986,被引用1000多次的論文,帶大家梳理一下AAV的血清型。論文題目“Analysis of AAV Serotypes 1–9 Mediated Gene Expression and Tropism in Mice After Systemic Injection”想深入學(xué)習(xí)的同學(xué),可以自己解讀一遍,后面待機(jī)閱讀原文即可跳轉(zhuǎn)文章。


01
AAV基礎(chǔ)知識(shí)


首先,解讀這篇文章之前,先給沒(méi)有基礎(chǔ)的同學(xué)介紹一下AAV。


AAV屬于微病毒科,是一種長(zhǎng)度為26 nm、長(zhǎng)度為4.7 kb的線形 DNA病毒。AAV通常與腺病毒同時(shí)存在,是在腺病毒制劑中首次發(fā)現(xiàn)的一種污染物質(zhì)。


AAV單股 DNA含有 ITR, Cap, Rep 3個(gè)組分.ITR為發(fā)卡型結(jié)構(gòu),為 AAV拷貝與封裝所需要的惟一順式元件;Cap為病毒的核漿蛋白編碼,使得病毒具備了侵染的能力;而 Rep,則是負(fù)責(zé)病毒基因的復(fù)制與整合。



基于野生型AAV構(gòu)建的重組腺相關(guān)病毒(rAAv),理論上可攜帶小于5kb分人基因(通常小于2.8kb)。


AAV病毒是一種新型的病毒,其病毒具有多種類(lèi)型,而不同類(lèi)型的病毒對(duì)不同組織/器官具有不同的轉(zhuǎn)染效率(組織嗜性),其表達(dá)量及持續(xù)時(shí)間也各不相同,所以有必要來(lái)了解不同類(lèi)型的病毒之間的差異。



一分鐘讀懂論文


01
表達(dá)速度

表達(dá)最快:AAV1、6、7、8和9

表達(dá)中等:AAV4和5

表達(dá)最慢:AAV2和3

02
表達(dá)水平

低表達(dá):AAV2、3、4和5

中表達(dá):AAV1、6和8

高表達(dá):AAV7和9

03
不同血清型組織嗜型(表達(dá)量由高到低)

AAV9最光譜,在所有組織中均表達(dá),且表達(dá)水平很高

AAV7多種組織表達(dá),但在大腦、睪丸、腎臟中無(wú)表達(dá)

AAV1主要在肝臟中表達(dá),其次是心臟和后肢骨骼肌

AAV6主要在心臟中表達(dá),其次是肺

AAV8主要在心臟中表達(dá),其次是排腸肌、腘繩肌和肝臟

AAV2主要在肝臟中表達(dá),其次是心臟和腘繩肌

AAV4主要在心臟中表達(dá),其次是肺

AAV5僅在肝組織中表達(dá)

AAV3的表達(dá)水平更低,主要在心臟和肝臟中表達(dá)

04
AAV9表達(dá)持久性最高,其次為AAV6-8,AAV1和4持久性最低
05
所測(cè)試的AAV血清型對(duì)心臟功能均無(wú)任何影響


文章解讀

01
實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)


  在AAV1-9的包裝載體上添加熒光素酶基因cDNA,構(gòu)建不同血清型的AAV,尾靜脈(TV)注射后,在注射后的7、14、29、56和100天(days post-iniection,dpi)對(duì)注射不同的血清型動(dòng)物進(jìn)行成像,通過(guò)luc的表達(dá)量測(cè)定不同血清型AAV的表達(dá)。


圖片

02
不同血清型表達(dá)開(kāi)始的時(shí)間


  AAV1、6、7、8、9的表達(dá)量最快,luc的表達(dá)量在7dpi即可檢出;AAV4、AAV5的表達(dá)率適中,其表達(dá)在14dpi,AAV2、3的表達(dá)最為緩慢,只有在29dpi時(shí),Luc的表達(dá)才能檢測(cè)出來(lái)。


圖片

03
不同血清型的表達(dá)水平


AAV2、3、4、5為低表達(dá)組(Low-expressuon Group),表達(dá)范圍5,000-200,000 photons/second/cm2;

AAV1、6、8為中表達(dá)組(Medium-expression Group),表達(dá)范圍為15,000-200,000 photons/second/cm2

AAV7、9為表達(dá)組(Hight-expression Group)High-expression Group,表達(dá)范圍為10,000-1,000,000 photos/second/cm2


圖片


04
不同血清型的組織嗜性(表達(dá)量又高至低)


AAV9最光譜,在所有組織中均表達(dá),且表達(dá)水平很高;

AAV7多種組織中表達(dá),但在大腦、睪丸、腎臟中無(wú)表達(dá);

AAV1主要在肝臟中表達(dá),其次是心臟和后肢骨骼??;

AAV6主要在心臟中表達(dá),其次是肺;

AAV8主要在心臟中表達(dá),其次是排腸肌、腘繩肌和肝臟

AAV2主要在肝臟中表達(dá),其次是心臟和腘繩肌

AAV4主要在心臟中表達(dá),其次是肺

AAV5僅在肝組織中表達(dá)

AAV3的表達(dá)水平更低,主要在心臟和肝臟中表達(dá)


圖片


05
不同血清型表達(dá)開(kāi)始的時(shí)間


  本項(xiàng)目以AAV1型,6-9型小鼠為研究對(duì)象,采用免疫組化技術(shù),分析其在AAV1型和6-9型的小鼠體內(nèi)的存留量,確定其在AAV1型和6-9型小鼠體內(nèi)的存流量。發(fā)現(xiàn)AAV1、AAV4的濃度在1-6h后降低較快,AAV6-8濃度降低較快,AAV9濃度降低較慢。48h后,每個(gè)血清中的初始表達(dá)量不到1%。


  對(duì)100dpi后,不同血清型的組織樣本進(jìn)行了DNA測(cè)序,結(jié)果顯示,不同血清型組織樣本中,HBV的DNA序列有明顯的變化。


圖片



0

6
不同血清型的心臟功能的影響


  在進(jìn)行了100天的尾靜脈注射后,以超音波心動(dòng)圖來(lái)評(píng)估其對(duì)心功能的作用,并發(fā)現(xiàn)所有被測(cè)的AAV血清型對(duì)心功能沒(méi)有影響。


圖片

  總體來(lái)說(shuō),這篇文獻(xiàn)對(duì)AAV1-9血清型進(jìn)行了比較全面的試驗(yàn)研究,對(duì)于剛接觸AAV的同學(xué)來(lái)說(shuō),看懂這篇論文會(huì)對(duì)不同的AAV血清型有個(gè)初步的了解,如果要進(jìn)一步深入學(xué)習(xí),當(dāng)然要看更多的文獻(xiàn)。


  看完了這篇被引用1000多次的論文還不過(guò)癮的同學(xué),可以挑戰(zhàn)下這篇2019年2月1日發(fā)表與Nature Reviews Drug Discovery,影響因子64.797的文章“Adeno-associated virus vector as a platform for gene therapy delivery”,看完這篇文章,“凡爾賽文學(xué)”你也行。






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